Рекурсивная Архивация
 

Ну вот, разобрались кажется с разархивацией. Теперь архивация:

Нужно задать начальный фолдер и потом чтобы содержание каждого сабфолдера зипнуть в нем же, а потом удалить исходные файлы.
Вот такая прога мне нужна.

WinRAR 3.2 - выдели нужные файлы (директории) для архивации. Правый щелчек мышью на них и Add to archive, затем отметь опцию Delete files after archiving, перейди на закладку Files и отметь пункт Put each file to separate archive.