Какой командой завершается работа компьютера?
По идее, по команде shutdown -r -m \\удаленный_комп\, на компе который выключается выдается табличка о завершении работы системы (см. вложение) и все. По истечении определенного времени (умолчание - 30 секунд если не была введена команда shutdown -a), комп завершает все задачи и перезагружается (ключ -r - перезагрузка, выключение -s).
Если не помогло, то попробуй добавить ключ -y.
Ответить утвердительно на все запросы компьютера.
А вообще:
http://support.microsoft.com/?scid=h...kb%2f317371%2f