Из одного окна в общем случае нельзя получить доступ к свойствам другого, если они принадлежат разным доменам. Единственный возможный способ - это если у тебя страницы расположены на различных доменах третьего уровня, но домены второго уровня совпадают, то можно понизить строгость проверок до совпадающего домена через установку document.domain. Вот
тут подробнее написано.
В остальных же случаях остается только передавать через URL или post-запрос новому окну список параметров, чтобы оно само себя уже настраивало после открытия.