так ведь можно спокойно выбрать куда будеш ставить винду при установке , вот вмсето первой партиции ставь на другую , винда сама создаст на перовм диске загрузочные файлы , 100% сделает так если у тебя есть расширенный DOS раздел , если все партиции являются первичными то может и сделать активной вторую партицию , хотя очень сомневаюсь что первая будет при этом пустой
ps : сам никогда таким извратом не занимался