честно говоря, не знаю - она отлично после копирования работает
впрочем (если я не путаю ее с другой прогой) - надо пройтись по настройкам и позаменять абсолютные пути (типа c:\miranda\sound) на относительные (.\sound)
но могу ошибиться
по крайней мере, у меня миранда на флешке - развернутый зип с плагинами; работает без проблем