Под Win -
µTorrent по моему самое оно.
Под Linux -
Azureus показался мне самым оптимальным вариантом, и GUI имеется и WEB фейс. Пробовал kTorrent еще что-то пробовал не помню
все не то, глючит или работает не так как ожидается.
Ну а в консоли
rTorrent по моему вне конкуренции, стоит на FreeBSD и не вызывает ни малейших проблем.