А Download Master не пойдет? Я им закачивал несколько тысяч файлов - без проблем и достаточно шустро....
Но вообще то мне кажется что никакая из общедоступных программ не может быть рассчитана на скачивание 100000 файлов...
Тут может быть проще самому написать простую программу на например VisualBasic...