просто загрузка с независимого источника возможно и решит вопрос, но не проблему. разумеется, ваше дело - насколько сие вас устраивает.
Смысл использования Far или TC в первую очередь связан с тем, что виндовый проводник (копипаст) - далеко не самое лучшее средство для копирования в принципе, а больших объёмов со сложной структурой - тем более. Использование в данном случае нормальных файл-менеджеров исключит данные опасения. Кроме того, в тотале есть такое замечательное средство, как
"Синхронизация каталогов" (про Фар не в курсе).
а насчет поправок относительно правильного обозначения объектов обсуждения - еще раз говорю: чем правильней поставлен вопрос, тем быстрей найдется ответ. по сабжу - есть еще и "Безопасный режим" загрузки, например. под ним и фар и тотал работать будут. есть режим загрузки командной строки, как я выше писал. я просто привел то, что требует наименьшего проявления телепатии.