Неплохо работают Easy Video Joiner
http://www.doeasier.org/joiner/
AVI/MPEG/RM Joiner
http://www.boilsoft.com/avi-mpeg-rm-joiner.html
TMPGEnc Plus
http://www.pegasys-inc.com/e_plus_product.htm, провда этот только для MPEG-1/2
Movie Joiner 2.11
http://www.imho.ws/showthread.php?s=&threadid=34027
Ссылки на лекарства поищи на форуме в соотвествующих разделах или в обменнике.
Мне больше нравиться AVI/MPEG/RM Joiner, хотя на вкус и цвет...