aleks_k2 
в этом варианте - согласен. 

  но с чего он вдруг началь разжимать аудио???
чего мы гадаем, 
Zhiberya , а какой формат (видео/аудио) у каждого файла на входе, и какой получаем на выходе? глянь через тотже VD -> File -> File information. Размер, фреймрейт и кодек видео; Sampling Rate, Compression и Data Rate для Аудио.
хотя, я как-то попопробовал склеить через него два куска с аудио разного битрейта, - Dub просто ругнулся и ничего делать не стал. но это было в довольно древней версии, мож сейчас он это дело решает именно путем разжимания аудио в uncompressed 

 - вполне возможно... попробую на досуге. 
PS. Проверил. 
Dub 1.5.4 не берет через Append AVi Segment AVI'шки с одинаковым видео и разным звуком. выдает 
'Cannot append segment: The audio streams have Different sampling Rates'