Смотря в чем делать баннеры в gif или swf!
Соответвсенно это Adobe Photoshop если ты обладаешь планшетом и основами рисования покадровых изображений в ручную, либо Ulead Gif Animator если хочется попроще, а вообще была стильная вещь, называемая Meta Creation Headline Studio - лучшая для гиф-анимации, я в своё время с нее начинал. Проблема в том что она закончила своё существование на 1 релизе и сейчас ее сложно откопать. Конечно если тебе ТАК СИЛЬНО НАДО то могу скинуть куданить, она весит 4 мега...
А для флашовых баннеров лучше Macromedia Flash нет ничего!
Так что думай сам че те надо...