Была похожая проблема - оказалось питание!! Т.Е. оно было нестабильным! Причем периодически скакало в больших пределах - 10-30 вольт!! С винта слетала таблица ФАТ как миленькая. Советую - проверь блок питания, иначе без винта снова останешбся
P.S. Винт тоже шаркал через какое-то время - пропадало питалово - головки портировались на 1-ю дорожку...