Я имею ввиду всё абсолютно, что у тебя запускается с системой.
Посмотри имеются ли какие особенные службы, в смысле отличные от стандартного набора при голой винде, т.е., например после установки Каспера появляется его служба и т.д. Смотри внимательно, возможно там собака зарыта.
Можешь попробовать программу BootVis - показывает что у тебя происходит во время загрузки.