НУ тогда флаг вывешивать после запуска проги.
Код:
#( Photoshop_Int_Assistant
AsLoggedUser
WatchProc: "Photoshop.exe"
Rule: PROC-EXIST: "PIAssistant.exe" NOT
FILE-EXIST: "C:\Flags\PIAssistant.flg" NOT AND
Action:
FILE-CREATE: "C:\Flags\PIAssistant.flg"
PAUSE: 1000
StartIn: "C:\Program Files\Photoshop Interface Assistant"
ShowNormal NormalPriority
START-APP: C:\Program Files\Photoshop Interface Assistant\PIAssistant.exe
)#
Пауза - время на создание файла.
Только не забывай его (флаг) удалять после окончания работы.