[Premium]

Dr.Dre
Если только средствами винды, то наверно сделай файл *.vbs:

Set WshShell = WScript.CreateObject("WScript.Shell")
WScript.Sleep 5000
WshShell.Run "notepad.exe ", 1, false
Set WshShell = Nothing
WScript.Quit

И в автозагрузку вместо MSN напиши "wscript.exe этот_файл.vbs "
вместо notepad.exe экзешник MSN , 5000 - это пауза перед запуском в миллисекундах, сколько там надо тебе. А вообще есть несколько небольших утилит, которые тоже могут ждать заданное время и потом запускать приложение.