В последних версиях Linux отличные Boot Manager'ы. С графикой и другими радостями. Насчет загрузчика. Есть два варианта. Использовать Lilo и его потомков, которые идут в дистрибутиве Linux. Ставить их лучше всего в загрузочный сектор. Делать это при установке Linux. Тогда же указать где стоит винда, чтобы она сразу добавилась в список загружаемых систем. Потом это можно сделать в настройках загрузчика.
Второй вариант - использовать загрузчик Windows (если конечно у тебя NT-евая версия винды). Гемора больше, и так как ты похоже с линуксом раньше не связывался, и переставлять ты его по началу будешь часто, то лучше первый вариант. Второй описан во всех FAQ по WinXP.
Делать отдельный раздел для ядра (загрузочный раздел) - какой смысл, это надо для постоянной работы в Линуксе. А тебе так - потренироваться, побаловаться

. Так что делай 2 раздела для Линукса. Свап и основной "/".
И самое главное. Когда снесешь Линукс, тебе надо будет убить его загрузчик. Делается это так. Грузишься с виндового CD и выбираешь Консоль восстановления (R кажется нажать). В командной строке пишешь:
fixmbr (это точно так)
fixboot (кажется так, но на всякий случай набери в консоли help, проверь)
все, Reboot