По поводу дефрагментации -- RAID у тебя поддерживается аппаратно, т.е. ОСь видит один диск. А дефрагментируешь ты файловую систему. Поэтому с этой точки зрения нет никаких отличий между одним диском и RAID'ом. Пользовать можно любые дефраги. Недавно об этом был разговор в "ОСях":
http://www.imho.ws/showthread.php?t=72346