Intel Application Accelerator у меня не наблюдается.
Проблема решилась переносом своп-файла на другой раздел с системного, как Dr.God прописал
Там оно выделяет ровно столько, сколько указываю.
Интересно с чем это все ж связано - может действительно, как Yraman говорил, из-за дефрагментации и глюков в файловой системе?
Если найду причину - я тут подпишу, авось кому пригодится.
Всем спасибо за советы.
