Можно я попробую ответить? В меру понимания, конечно.
Насчет БМГ - ему нет необходимости возвращаться совсем в начало. При загрузке с 0 дорожки считывается транслятор, данные по разметке, потом уже MBR, BR и уходим в начало таблиц ФС, где и живем, по необходимости прыгая к секторам данных. Положение головки зависит в основном от алгоритма, находящегося в прошивке, но чаще всего после обращения к данным БМГ возвращается в зону ФС.
Насчет 300000 файлов на 40 гигах-по моему несколько спорно, но развивать не буду пока.
По поводу резервирования места.
Насколько я на данный момент понимаю - MFT в достаточно грубом приближении можно сравнить с базой данных, имеющей в своем распоряжении средства для резервного копирования и восстановления данных, а также индексные данные, которые и позволяют не пробегать всю цепочку до совпадения и не держать всю ее же в памяти постоянно, а обращаться напрямую к данным. Причем по аналогии с индексными же файлами при сложном индексе или при нескольких индексах в одном индексном файле складывается ситуация, когда этот файл становится размером больше, чем сам файл БД, который индексник и должен обслуживать.
Считая, что предельо допустимое количество записей в файле БД фиксировано, мы получим следующую картину: сам файл БД, его копия, средства контроля и индексник находятся на фиксированном же пространстве, значит и размер индексника фиксирован. Но при каждом добавлении\изменении записи он растет быстрее, чем сами файлы данных. Наступит такой момент, что хранить его придется уже в сжатом виде, что плохо скажется на быстродействии системы- распаковать-получить-прочитать-изменить-запаковать.... писать устанешь!
Думаю, что именно для этого и расширяется резервируемое место.
Косвенно в мою пользу выступает факт того, что отключение в реестре контроля даты-времени последней модификации файла тоже ускоряет работу ФС - мы просто выбиваем из индексника одно из полей, уменьшаем его сложность и объем, а следовательно ускоряем по нему поиск, и соответственно чтение даннных.
Конечно, изложил я все в своем понимании, несколько обобщенно и утрированно, но думаю, правильно.
Критику приму как должное - умнее буду ведь.
Засим все.... спать, спать.... 5-30 по Москве....