Еще вспомнилось, похожее примерно.
На Гигах на 915 сокете в БИОСе почему-то была строчка определения подключения кулера CPU - 4 или 3 пина. По умолчанию выставлено обычно на 3, а-ля серверный вариант мониторинга-управления кулерами. Однажды забыл выставить на 4, на 3 осталось, и система завелась и работала, но в какой-то момент потеряла кулер и заверещала. Пока искал трабл, мать снова кулер нашла и работала дальше.... потом опять потеряла....
Вроде похоже, но не знаю, на матери автора есть такая фишка, или нет. Да и корпус открыть нельзя....