наверняка тебе удобнее чтать все в одной теме.
но тем кто будет отвечать проще если в заголовке темы конкретный вопрос, на который можно дать конкретный ответ.
так, реверанс в сторону нетикета
судя по названию кернела, у тебя альтовский дистрибутив.
У них на сайте есть инструкция по настройке apt (synaptic) для работы как со stable, так и с urgent репозиториями. Какой нужен онписывается там же.
вообще apt'у говоришь - поставь пакет такой-то. все остальные либы он сам стянет.
Антивирус для чего нужен?
ntfs модуль в ядре есть.
забудь про фрагментацию. fsck в разных ипостасях достаточно