[Saruman]

не выдает ли ошибок при старте?
BTW, php -m показывает compiled-in modules, т.е. те модули, которые были включены при компиляции. Если у тебя там есть gd - то должно все работать.
Если совсем не получается - попробуй перекомпилировать php с указанием --with-gd - при этом php компилируется с использованием встроенного gd, что предпочтительнее. Если же тебя встроенный почему-либо не устраивает - то можешь указать --with-gd=/path/to/gd для использования твоего gd.