keeper_c,
скорее всего загрузочный сектор на другой винт встал, а биос, наверное, загрузка с виндового диска с системой (если это так, то в биосе диск для загрузки выбирай с загрузочным сектором, хотя я бы в этом случае загрузчик с сектором все ж на виндовый диск перенес
..)...
посмотри что в
boot.ini и где (на каком винте) находиться
ntldr??