В принципе должны работать спокойно. БИОСы должны загружаться последовательно.
Как вариант-имел плату мультиконтроллерную-на одной було реализовано отдельными чипами ИДЕ, отдельно САТА, и еще кой-что.
Опознавалась в системе кучка контроллеров и все
в смысле работало