ну вряд ли в проблемах с разделом виноват "мой способ"...

скорее всего, он умер до того, как ты скрыл разделы. "скрыть раздел" в данном контексте - означает "отмонтировать его и не монтировать при следующем старте системы". с разделами винда обращается корректно, разве что при попытке доступа к незнакомым разделам предлагает отформатировать их