Можно использовать VirtualDubMod или VirtualDubMPEG, но придется повозится... вырезать лишнее, сохранить звук отдельно (иначе рассинхронизация произойдет), отключить его, сохранить видео как AVI (полная обработка), можно там же приклеить звук и снова сохранить уже готовый AVI (прямопотоковое копирование)... ну а потом создавать DVD-файл в любой доступной программе для этих целей,например NERO Vision или Ulead DVD MovieFactory 4.0.
SmartRipper - С программой SmartRipper можно не просто скопировать на винчестер весь фильм целиком, но и выбрать отдельные эпизоды, которые следует скопировать/пропустить. С помощью SmartRipper можно объединять несколько *.vob'ов в один, и делить один *.vob на несколько.
Программа умеет правильно открывать и закрывать порезанные файлы, что жизненно важно для некоторых декодеров.
http://www.3dnews.ru/download/dvd/smart-ripper/
http://www.3dnews.ru/reviews/multimedia/dvd-rip/