После того, как пришлось извращаться с мультизагрузкой средствами винды, я наоборот предпочитаю сначала ставить винду, а уже потом - линукс. Нормальные дистрибутивы и виндовые разделы подмонтируют сами, и LILO поставят именно в MBR, где ему и положено быть
.