У меня в VB похожая проблема. В винде это называется "программа ожидает ввода информации". В этот момент в строке пуска мигает кнопка. Так?
Если так, то я выхожу слд. образом: Form1.Show. Это не правильно, но работает. Если не срабатывает, можно сделать раз десять