Так по порядку:
Оригинальная таблица в формате paradox (это очевидно, зачем открывать одно, а сохранять другое, хотя и такое бывает

).
Проблема именно в сохранении (открыть можно через временный TTable или еще как, в общем с этим проблем пока нет).
Оригинальная таблица конечно открыта в проге, ну в принципе закрыть не трудно (active = false). Сохранение пробывал через функцию копирования API, но там проблемы с самими таблицами, так как при их измении создаются дополнительные файлы которые потом не учитываются... вот и проблема.