Чем кодируешь ? Если
TMPGEnc, тогда вот:
№1 - прога не приемлет
XviD.
Решение "в обход" - пережми в DivX 4 или 5, потом пиши в VCD
№2 - прога не приемлет звук с VBR (Virtual BitRate). У тебя именно он
Решение "в обход" - "Оторви" аудиотрек от фильма (НанДуб или ВиртуалДуб), перекодируй без VBR или раскрой в PCM(uncompressed) WAV (Winamp -> output plugin -> DiskWriter) потом пиши в VCD, звуковую дорожку вставляй новую
Решение "без обходов" - жди версии, поддерживающей эти кодеки