То что в трее висит только память жрет, да и не факт что много. Вот у меня из 256 мозгов постоянно простаивает около 100, так что не стоит экономить на спичках. Главное это удобство работы.
А что касаемо большого колличества ярлыков на десктопе, то у меня тож раньше почти весь был забит

) Ну а потом я нашел класную прогу Type&Run и ярлыков стало гораздо меньше. Юзайте правильный софт, он естьт рулез.