Есть такая прога - ERD commander называется, так там есть кроме других утилит свой редактор реестра. Запускаешь его показываешь ему системную папку, например - Windows. И можешь редактировать реестр в другой системе. Кроме того, я уже сдесь писал об этом, есть прога PEbulider
http://www.nu2.nu там в качестве плагина тоже можно использовать ERD commander.