instmsiw.exe устанавливает тот самый Windows Installer, который входит в состав Винды, и, соответственно, если после его переустановки Ты не можешь переустановить/удалить ранее установленные программы при помощи "Установка/удаление программ", то спастиТебя может, пожалуй, только переустановка Винды, т.к. повреждение на уровне реестра по другому не исправишь (можно вручную, но дешевле переставить Винду)...
Файлы и папки в директориях Windows и Program Files прячет от Windows Explorer сама Винда; если у Тебя папки отображаются в виде WWW, то достаточно щёлкнуть по ссылке "Показать все файлы" рядом с предупреждением о том, что это опасно...
Или можно залезть в свойства папки и настроить на "Показать все файлы".