Я конкретно такой проги не знаю, но сделал бы просто:
Загнал бы список всех нужных файлов с полным путем из каталога в текстовый файл (уж таких прог точно много). Чтобы там получилось нечто вроде:
c:\mysite\1.htm
c:\mysite\2.htm
c:\mysite\3.htm
...
А потом в любом бы текстовом редакторе сделал бы по файлу поиск/замену: "c:\mysite\" на ">...</a><br><a href="
Ну а потом в начале и в конце бы поправил две строки.