не используйте phpMyAdmin для манипуляций(экспорт, импорт) баз данных больше 2-3 мб для этого есть нормальные инструменты. из дешевых, бесплатных и удобных могу посоветовать:
Site Keeper Dumper LE 1.0.4 © 2003 zapimir
использую уже второй месяц - очень доволен
из серьезных продуктов можно обратить внимание на разного рода комплексные продукты таких фирм как, например: EMS.
также весьма удобны "родные" утилиты от mysql(из новых), но почти все они не поддерживают mysql3.x
