Предлагаю два решения (для .bat/.cmd):
1) В каждый скрипт в конце добавлять комманду PAUSE. оно будет просить "эникея" для продолжения и, следовательно, завершения.
2) Изменяем параметры запуска вышеозаченных жертв.
а. Грузим regedit, идем в HKR\cmdfile или HKR\batfile
б. открываем ключ shell\open\command
в. меняем значение
на