А накой отключать?
По уму давно в БИОСах есть строчка типа "Boot Select" или Priority, дык там и ставишь, какой винт бутовый. Если оба винта определились в БИОСе, то там оба и отобразятся.
Фокус в том, что некоторые связки мать+БИОС произвольно устанавливают там порядок загрузочников - некоторые вешают первым SATA, некоторые IDE.
Решаем просто - лезем с CMOS, настраиваем оба харда на определяемость, перезагружаемся, снова в CMOS если зацепились, и в искомой строчке ставим необходимый ака загрузочный. Все!
За это уже писалось многократно
