Проблемы как прошивки БИОСа, так и определения SATA-винтов.
Они могут в расширенном режиме во многих БИОСах определяться как SATA - каналы(и тут надо искать комбинацию райд-опций, при которой они будут в БИОСе детектиться и в загрузку выходить), или IDE-каналы, тогда и рейд смотреть надо, и какие каналы в БИОС им отдаются. Оченно часто идет предложение заместить ИДЕ, то есть SATA к примеру канала 0 становится праймари мастером, канала1 - праймари слэйвом.... типа того.
Все это несколько индивидуально, и, поскольку БИОС данной матери не помню, а под рукой такой нет, могу только так.... в общем...