Есть такая программа, Startup Faster 2004 называется. Иди
сюды
Утилита Startup Faster 2004 значительно ускоряет процесс загрузки операционной системы. Как правило, приложения, которые стоят в автозагрузке Windows начинают одновременно запускаться, что приводит к резкому торможению компьютера. Startup Faster 2004 организует процесс загрузки системы таким образом, что приложения стартуют одно за другим. Ты сможешь задать интервал времени для стартующих программ, и расставить их в очередь, кто за кем.